房地合一稅制經過財政部及行政院不斷地修改相關細節，到立法院三讀通過的那一刻，才正式確認相關課稅規定。在這立法過程中，每每遇到重大改變，所有媒體與網路便以最快速度更新相關訊息，同時附帶學者專家針對此重大稅改之見解，資訊傳播多元化與龐雜，常令一般市井小民在未全盤了解的情況下，不自覺地陷入「瞎子摸象，以偏概全」的迷思中。
任何的「稅」都是導因於納稅義務人所選擇的交易模式，誤信迷思所進行交易，將產生超乎預期的稅負，這樣的結果相信是所有人的惡夢。因此，我們將針對房地合一稅制相關迷思進行逐一分析，點出應考量的因素，讓大家能針對自身情況進行全盤考量，在交易進行前，正確選擇最適當的交易模式，避免因忽略關鍵因素而導致不必要的稅務風險。
迷思1：設立國內公司買賣房地產適用稅負較低???
按房地合一稅制，國內公司買賣房地產的所得，不論持有期間長短，都併同公司其他所得一體適用17%之所得稅率，對比個人或境外公司的短期高額稅率，似乎設立國內公司能享有較低稅負，但真得是如此嗎???
其實結果正好相反，誤信此迷思反而將使自己負擔更多的房地合一稅，會產生如此迷思，主要是忽略「整體」的商業行為才是衍生總體稅負之關鍵。何謂「整體」??? 在任何公司主體之商業行為，就如同左圖所列示，應該至少都有5個基本要素，由這5個要素所組成的循環構成一個「整體」的商業交易藍圖。
其實，該循環圖其實在告訴我們 “個人設立公司進行交易產生之盈餘，終將分配回個人”，因此，任何公司交易模式所衍生之交易稅負終將由個人負擔，下圖呈現房地產從交易到盈餘分配股利所伴隨的稅負，顯然，形成此迷思的關鍵就在於「僅考量公司層面的所得稅」。
在新制的房地合一稅制下，設立公司買賣房地產，必然會有下列幾個循環要素，而相關的成本費用與稅負，亦將伴隨下列循環要素而生：
- 個人設立公司：公司設立費用與維持費用
- 公司進行交易：5%營業稅
- 產生交易稅負及盈餘：17%營利事業所得稅，10%未分配盈餘稅
- 盈餘分配至個人：個人綜合所得稅，股東可扣抵稅額減半
由此可知，設立國內公司買賣房地產，在房地合一稅制下，相關稅負不僅止於17%營利事業所得稅，還必須考量：
- 房地產交易價金之5%營業稅
- 房產交易所得分配予個人時，公司盈餘轉變為個人股利所得(上圖紅色部分)，將按個人所得金額大小適用5%~45%之稅率。
- 房產交易所得之盈餘未於交易之下年度配時，10%未分配盈餘稅隨之而來。
- 兩稅合一減半抵繳個人綜所稅實施後，個人股利所得之綜合所得稅原本可以全額抵扣17%營利事業所得稅與10%未分配盈餘稅，變成只能抵扣半數，變相讓個人股利所得之稅負上升。若有繳納未分配盈餘稅，則可能變相增加13.5%以上的稅負。
在全盤考量上述關鍵要素後，設立國內公司買賣房地產享較低稅負之迷思，就不攻自破。讓我們以一個簡化的例子，認清迷思所帶來的稅負危機。假設持有房地產2年以上，買入成本500萬，賣出價格1,000萬，盈餘未於交易次年度分配，不考量相關費用、土增稅與個人綜合所得稅之扣除額與免稅額，以個人買賣房產需繳100萬之稅負，但公司買賣房地產，最終產生之稅負增加至225.3萬(相關計算詳下表)，差距如此鉅大，不可不愖!!!
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